STEINS;GATE, ocurre un año después de los eventos ocurridos en CHAOS;HEAD en Akihabara. STEINS;GATE trata acerca de un grupo de amigos que modificaron su microondas (Microwaves) conviertiendolo en un dispositivo que puede mandar mensajes de texto al pasado. Mientras realizan diversos experimentos, una organización llamada SERN, que ha estado realizando su propia investigación sobre viajes en el tiempo, los localiza y ahora los personajes deben buscar una manera de evitar ser capturados por ellos.