Tres chicas adolescentes japonesas de distintos colegios que se encontraban en una salida escolar de visita a la Torre Tokio son transportadas a otro mundo, invocadas por la princesa Esmeralda. Ese mundo se llama Céfiro
y allí les encargan salvar al planeta rescatando a la princesa de las manos de un tal Zagato. Anahí, Lucy y Marina son convertidas en Guerreras Mágicas por el mago Guruclef comienzan así a recorrer el planeta incrementando sus poderes y habilidades para final mente despertar a los genios con los
que combatirán. En la batalla final descubrirán que no fueron traídas a Céfiro por lo que les dijeron y que nada es exactamente lo que parece...

Varios días han pasado desde el retorno de las tres chicas a la tierra tras el trágico final de la batalla en Céfiro.
Ellas se encuentran reunidas en la Torre Tokyo recordando lo sucedido cuando son súbitamente transportadas nuevamente a Céfiro. Pero este es ahora un planeta muy distinto del que conocían, se está desintegrando, está oscuro y devastado, sin océanos ni ríos...
Además, seres de 3 planetas (Autosam, Sizeta y Farem) los quieren invadir. Las guerreras Mágicas deberán defender Céfiro nuevamente, y aquí más que nunca nada será lo que parece.